Der Semuliki-Nationalpark erstreckt sich über den Talboden des Semliki-Tals an der abgelegenen Westseite des Ruwenzori-Gebirges. Er wird vom östlichsten Ausläufer des großen Ituri-Waldes im Kongobecken dominiert. Dieser Wald zählt zu den ältesten und artenreichsten Wäldern Afrikas und ist einer der wenigen, die die letzte Eiszeit vor 12.000 bis 18.000 Jahren überstanden haben.